自動で行うには、以下の.htaccessによる対処が必要です。

<Files update-core.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</Files>

上記を.htaccessファイルに記述し、wp-adminディレクトリに置けば、自動コアアップグレードするようになります。

また、まとめとして

<files async-upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>
<Files plugin-install.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</Files>
<Files update.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</Files>
<Files update-core.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</Files>

を記述した.htaccessファイルをwp-admin/ ディレクトリに置けば
ファイルアップロード、プラグイン新規インストール、テーマ自動アップグレード、コアアップグレードも自動で行ってくれます。

その他のサーバーでの自動アップグレード機能の動作状況などは、
WordPress 日本語Codexにてご確認頂けます。
http://wpdocs.sourceforge.jp/Core_Update_Host_Compatibility

これはphpがセーフモードで稼働している為であり、該当phpをcgiで動かせば自動でできるようになります。

<Files update.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</Files>

上記を記述した.htaccessをwp-admin内に置けば自動でアップグレードできるようになります。

<files async-upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>

Flexible Uploadプラグインを使うには、上記のままでは

アップロードしたファイルを*****/wp-content/uploads/2008/05に移動できませんでした。

とエラーになります。

これを回避するには、対策として.htaccessの記述をに以下のようにします。

<files async-upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>
<files media-upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>

つまりmedia-upload.phpをCGIとして動作させるための設定を行えばOKです。

その対策としてwp-adminフォルダ内に.htaccessファイルを使用してPHPをCGIとして動作させればよかったのだが、このたびME2.2.1からWordPress2.5日本語版にアップグレードしたら、

「アップロード中にエラーが発生しました。後ほど再度お試しください。」

とのエラーが出て、またもやアップロードが出来なくなった。
で、いろいろ試してみて.htaccessを以下のように修正したら、また無事アップロードできるようになりました。

<files upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>

これを

<files async-upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>

に変更したらアップロード出来るようになりました。

詳しくは解らないが、アップロードに関するファイルが、upload.phpからasync-upload.phpに変わったのでしょうか。

AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php

とだけ記入しても機能するが、すべてCGIとして動作してしまいます。。

以上の対策で、Mac、WinともFirefoxならこれで問題なく機能するようになりますが、
WordPressフォーラムのバグ報告「2.5 画像・メディアアップロード機能の問題（英訳）」にも上がってますように、IEで使うにはまだ色々と問題があるようで、うまくアップできませんでした。

/articles/%category%/%post_id%.html

に変更しようと、WPの管理画面から設定すると、サーバーにアクセス出来なくなります。

CPIサーバーでmod_rewriteを有効にするには
.htaccessで

Options +FollowSymLinks

という記述が必要になります。

これを先に記述してから、WPの管理画面からパーマリンクの設定を変更します。

※
この、先にOptions +FollowSymLinksを記述してから、WPの管理画面からパーマリンクの設定をするという順番が大切みたいで、いきなり直接下記を.htaccessに記述しても、リンク先はNot Foundとなります。

AddHandler x-httpd-php441 .php
suPHP_ConfigPath /usr/home/g123456/secure/wordpress/
Options +FollowSymLinks

<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>

まず最初に、CPIでPHPを動作させるには、
.htaccessファイルを設置し、PHPのバージョンを指定しなければなりません。

例：PHP 4.4.1 の場合

AddHandler x-httpd-php441 .php

CPIでPHPのご利用について

それから、CPIでは デフォルトのPHPの文字コードがEUC-JPになっており、WordPress ME 2.2.3ではUTF-8しか使えない為、PHPの文字コードをUTF-8にしなければ文字化けします。
対処法：
１）
CPIのコントロールパネルのお客様情報から、CPIで動作してるPHPのバージョンのphp.iniファイルをコピーし、以下の部分を修正する。

mbstring.internal_encoding = utf-8
mbstring.encoding_translation = Off

２）
secure/以下に、任意のフォルダを作成し、そこに修正したphp.iniをアップロード。

３）
.htaccessファイルに

suPHP_ConfigPath /usr/home/(ユーザーID)/secure/(任意のフォルダ名)/
例)  suPHP_ConfigPath /usr/home/g123456/secure/wordpress/

を追記。これで文字化けは解消され、UTF-8で運営できます。

AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php

を記述。

<files inline-uploading.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>

と 入れてたが、WordPress2.1からはinline-uploading.phpが無くなり、代わりにupload.phpになっているようです。ということで.htaccessも

<files upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>

と修正しなければならなくなっているようです。